Meiner Meinung nach sollte in Zweifelsfall das Motiv vorgezogen werden. Das Projekt von numisfreund heißt ja auch nicht ohne Grund
Motivanalyse der 2-€-Kursgedenkmünzen. 
Die Geschichte bzw. den aktuellen Anlass hinter einer Münze finde ich immer interessant. Aber wenn man diesen nicht so ohne weiteres (wie z. B. bei der dt. Bundesländerserie) erkennt, sollte eher das Dargestelle (also die Bauwerke) zur Analyse herangezogen werden, finde ich.
So müsste aus Vatikan 2004 "Petersdom und 75 Jahre Vatikan" aber konsequenterweise auch der Petersdom als Bauwerk als Motiv verwendet werden. 2005 ist es ähnlich: Das Thema ist zwar "Weltjugendtag in Köln", doch ist nur der Kölner Dom abgebildet.
Es ist auf jeden Fall oft schwierig, das sauber zu trennen. Viele Motive sind eben beispielhaft zum Anlass.